在16日晚间召开的北京市新型冠状病毒肺炎疫情防控工作新闻发布会上，北京市人民政府副秘书长陈蓓表示，经北京新冠肺炎疫情防控工作领导小组研究，按程序报批后，确定自6月16日起北京市突发公共卫生应急响应级别由三级调至二级。
陈蓓表示，从全球看，境外疫情呈现持续扩散蔓延态势。目前全球疫情短期内难以有效控制。境外输入仍是北京市最重要的疫情风险。
6月11日，北京市在连续57天无新增本地确诊病例后，再次出现本地病例。截至6月15日24时，累计报告116例检测阳性者，其中确诊病例106例、无症状感染者10例，所有病例均与新发地农产品批发市场有直接或间接的流行病学关联。此起聚集性疫情已波及9个区（丰台、大兴、海淀、房山、西城、东城、朝阳、石景山和门头沟）、28个街道（1个高风险、27个中风险），并在三个省引发相关病例（河北3例，辽宁2例，四川1例）。本起聚集性疫情初步判定由人际传播或物品环境污染引发的感染所致，且密切接触者中出现了明确续发感染。
陈蓓表示，北京市目前防范境外输入和本市及国内扩散风险形势严峻，必须主动出击、果断处置，抓紧抓实抓细各项防控措施，坚决把这次聚集性疫情控制住，坚决遏制疫情向市内外扩散。
北京市应急响应级别由三级调至二级后，将坚持“九严格”措施，包括严格社区封闭式管理和健康监测；严格公共交通体温检测和公共场所测温验码等措施；严格进出京管控，境外入京人员全部集中观察和核酸检测，中高风险街乡、新发地市场相关人员禁止离京等。
同时，北京市还发布了15条其他措施，包括中高风险街乡、新发地市场相关人员禁止离京，其他人员坚持“非必要不出京”，确需离京的须持7日内核酸检测阴性证明；严格口岸食品检验检疫，完善进口食品检疫标准，加强溯源管理；恢复社区封闭式管理；恢复各年级线上教学，高校学生停止返校；对监管、养老、福利、精神卫生等特殊机构场所，实行严格封闭式管理，重点防控输入性疫情和内部疾病传播。
陈蓓表示，二级应急响应级别下不需要停工停产，但是下调办公楼宇到岗率，鼓励远程、居家等弹性办公，鼓励错峰上下班；同时，图书馆、博物馆、美术馆等室内公共场所及公园景区限流30%，实行分时段预约限流、远端疏导等防控措施；室内外体育健身场所实行预约限流措施，停止开放篮球、排球、足球等团体及对抗性运动项目；关闭文化娱乐场所和地下空间体育健身场所、游泳馆等；坚持门诊预约挂号制度；停止开放境内跨省区市团队旅游业务。
下一步，北京市将持续分析评估国内外及本市疫情，根据疫情变化动态调整防控措施。
16日晚间举办的发布会上，北京市商务局二级巡视员王洪存表示，北京主要商超生活必需品供应稳定，果蔬货源充足，购物秩序良好，客流总体平稳。
发布会上，中国疾控中心应急中心副主任、国家卫生健康委专家组专家施国庆表示，目前没有证据表明三文鱼是新冠病毒的宿主或中间宿主。如果有人觉得存在新冠病毒暴露风险，或者是接触了可疑的病人、可疑的食品，应当进行核酸检测。建议人们无论是食用三文鱼或其他食品，都应该进行必要的清洗和加工。如果出现发烧症状，务必去发热门诊进行诊疗。
16日晚间，北京市教委通报，根据北京市突发公共卫生应急响应级别调至二级的要求，从17日起，北京市中小学各年级停止到校上课，在京高校学生停止返校。
北京市教委要求，各学校要及时通知每一名学生家长，同时做好线上教学的无缝衔接、心理疏导等工作，确保学生平稳进入居家学习。初三、高三年级也同步恢复居家线上教学。
此外，各中等职业学校、各在京高校（含高职）从17日起停止返校；学校可以通过线上办理、远程服务等方式，做好毕业离校工作；各类型幼儿园17日起均停止开园；校外培训机构继续暂停线下课程和集体活动。
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